Оставаясь в течение долгого времени ненапечатанным, труд Кирилова как ценный справочник продолжительное время имел, видимо, хождение в рукописи. По свидетельству И. И. Голикова, член Коллегии иностранных дел, действительный статский советник П. П. Курбатов собственноручно переписал эту объемистую рукопись [18, стр. 483, прим.]. Интересовался произведением И. К. Кирилова и академик X. Винсгейм, что подтверждает найденный в его бумагах и сделанный лично им частью на немецком, частью на русском языках, очень подробный (но доведенный только до «Сибирской губернии») конспект работы Кирилова. Сведениями из «Цветущего состояния Всероссийского государства» пользовались некоторые историки и экономисты XVIII в., в частности A. JI. Шлецер (60, стр. 219—226], И. И. Голиков [18, стр. 213, 350, 378, 484-494] и др.
До настоящего времени удалось обнаружить всего лишь три полных рукописных экземпляра «Цветущего состояния Всероссийского государства», причем каждый состоит из двух книг. В настоящее время один из этих экземпляров хранится в Отделе рукописей Библиотеки Академии наук СССР, два других находятся в Ленинградском отделении Института истории: один в собрании Н. П. Лихачева, другой в собрании Воронцовых.
В 1951 г. в ЦГАДА С. И. Волковым [16, стр. 90—91] был обнаружен еще один рукописный экземпляр труда Кирилова, вернее только вторая книга, из которой изъяты разделы об управителях, канцеляриях и конторах, школах, купечестве, гарнизонах и числе душ в полках. Вместо этого добавлены «Краткое известие» и «Табель о Санкт-Петербурге» из первой книги. Рукопись подвергалась какой-то переработке и пополнялась новыми сведениями. Причем часть этих сведений, относящаяся к Башкирии и г. Самаре (Куйбышев), позволяет думать, что вносились они в рукопись кем-либо из участников Оренбургской экспедиции и, может быть, по указанию самого автора.
Труд И. К. Кирилова впервые был опубликован М. П. Погодиным лишь в 1831 г., т. е. почти через 100 лет после смерти автора, под заглавием «Цветущее состояние Всероссийского государства, в каковое начал, привел и оставил неизреченными трудами Петр Великий, отец отечествия, император и самодержец всероссийский, и прочая, и прочая, и прочая».
В предисловии к изданию Погодин выразил сожаление, что при опубликовании труда И. К. Кирилова он не имел в распоряжении его подлинника, «истлевающего в каком-нибудь архиве», и должен был ограничиться не совсем исправной копией, что отразилось на качестве издания.
Действительно, погодинское издание имеет большие недостатки. Книга выпущена с большим количеством опечаток, ошибок и пропусков в тексте. В частности, в ней отсутствует раздел «О доходах», которым завершается описание отдельных губерний, провинций и городов в рукописных экземплярах. Кроме того, даже при поверхностной сверке рукописи с печатным изданием, в последнем можно обнаружить много искажений и неточностей. Отсутствие алфавитного указателя и пояснительных комментариев очень затрудняет пользование книгой.
Ряд недочетов книги был отмечен в рецензии, появившейся в № 12 «Московского телеграфа» за 1831 г. Но наряду со справедливыми нареканиями в рецензии были сделаны и незаслуженные выпады по адресу издателя. Несмотря на все недочеты, погодинское издание «Цветущего состояния Всероссийского государства» было и остается первым и единственным печатным изданием, и заслуга М. П. Погодина заключается в том, что он первый позаботился о сохранении для будущих поколений этого ценного источника для изучения петровской эпохи.
Следует сказать в заключение, что ни один из рукописных экземпляров не имеет заглавия «Цветущее состояние Всероссийского государства...», которое носит труд И. К. Кирилова в издании М. П. Погодина. Вместо этого каждая рукописная книга начинается кратким перечнем содержания, помещенным в печатном издании сразу же после заголовка: «Книга первая, в которой описаны губернии и провинции, в них города, гарнизоны...» и т. д. Причем ни в одном из рукописных экземпляров не имеется абсолютно никаких указаний на то, что автором этого труда является И. К. Кирилов. Указано только, что данная книга «собрана в Высоком Сенате» и «совершена 1727 февраля (число пропущено) дня».