На территории Национального парка горный климат, красивые ландшафты удачно сочетаются с обилием нарзанных источников, которых насчитывается более 100 с общим дебитом 50 млн л в сутки. Эльбрус - кладовая минеральных вод, подземная химическая лаборатория, которая вырабатывает и выбрасывает на поверхность углекислые воды типа «нарзан», «боржоми», «ессентуки».

Кабардинцы и балкарцы уже в отдаленные времена знали о целебных свойствах минеральных вод. Об этом свидетельствуют сохранившиеся следы ванн, высеченных в камнях близ источников, остатки примитивных деревянных и каменных приспособлений для купания, обнаруженные в верховьях Баксана, Малки и др.

Примерно в одном километре от пос. Эльбрус, вверх по течению реки Ирик, на высоте 1980 м над ур. м. находится минеральный источник, которым пользуются жители поселка и туристы, следующие по ущелью. Эта вода углекисло-железистая, гидрокарбонатная, кальциево-магниевая.

Группа источников находится в ущелье Адыл-Су. На левом берегу одноименной реки, в двух километрах выше впадения в нее Шхельды, среди речных наносов имеется несколько выходов слабо минерализованной углекислой воды. Со склона левого берега долины также сочится минеральная вода, отмечая свой путь ржавыми пятнами гидроокиси железа. На правом берегу реки Адыл-Су, несколько выше соединения ее со Шхельдой, в исключительно живописной местности также расположен минеральный источник. Самый нижний по течению реки Адыл-Су выход минеральной воды - на правом берегу реки, приблизительно в километре выше устья. Минеральные воды ущелья Адыл-Су - углекисло-железистые, гидрокарбонатно-хлоридные, кальциево-натриевые. Источник «богатырского напитка» есть и в Терсколе: на левом берегу реки Терскол бьет минеральная вода «Ачи-Су» («горькая вода» - балк.), но вкус названию не соответствует: нарзан очень приятный, освежающий.

Река, презрев родные горы,

Метнулась бешено со скал:

«Скорей на вольные просторы,

Тесны камней - сердец затворы!» -

И морю бросилась со скал.

Билял Лайпанов, перевод с карачаевского

Для высокогорной части Большого Кавказа характерны реки снежно-ледникового питания. Они имеют общие особенности: минимальные уровни наблюдаются зимой, когда таяние ледников дает ничтожное количество воды; максимальный уровень приходится на июль и август, когда происходит таяние льдов и снежного покрова на поверхности ледников.

По территории Национального парка протекают две основные реки: Баксан и Малка, принимающие ряд притоков. Истоки реки Баксан: Азау, Гара-Су, Терскол, Донгуз-Орун. Ее притоки: Когутайка, Юсенги, Адыл-Су, Ирик, Адыр-Су, Курмычи, Кыртык, Челмас и множество безымянных водотоков. Притоки реки Малки: Гара-Кол, Кызыл-Кол, Шау-Кол, Ингушли, Харбаз и другие.

62 процента территории Национального парка «Приэльбрусье» приходится на труднодоступный рельеф: скалы, ледники, снежные поля. Высокогорно-ледниковый (альпийский) рельеф включает, кроме горы Эльбрус, комплекс хребтов и массивов Главного и Бокового Кавказских хребтов.

Вот какое впечатление произвели горы Кавказа на Александра Дюма-отца: «На мгновение мы лишились дара речи перед этой удивительной панорамой: это не было похоже ни на Альпы, ни на Пиренеи, ни на что-либо виденное нами; казалось, что представить это не в состоянии ни одно, даже самое изысканное, воображение. Это был Кавказ...»

Значительную площадь - 155,5 км2, что составляет 15,3 % всей территории Национального парка, занимают ледники и снега: 93 ледника в верховьях реки Баксан площадью 99,1 км2, включая ледники Эльбруса в границах парка, и 8 ледников в верховьях реки Малки площадью 56,4 км2.

Изучение ледников Приэльбрусья началось в середине XIX в. Этому способствовали экспедиции Российской академии наук, Географического общества, Корпуса военных топографов и освоение района иностранными альпинистами с гляциологическими наблюдениями и описаниями. В начале XX в. по результатам съемок Корпуса военных топографов была составлена одноверстная карта Кавказа, а по ней создан первый каталог ледников.

Начиная с 30-х гг. на отдельных ледниках (Башкаре, Шхельде, ледниках Эльбруса) предпринимаются наблюдения, проводимые Кавказской ледниковой экспедицией, Харьковскими университетом и педагогическим институтом. В 1934 г. в Терсколе начала работу Эльбрусская комплексая экспедиция Академии наук СССР.